病毒表转录组
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“病毒表观转录组”包括通过“病毒表观转录组”研究的所有病毒转录本修饰。与更一般的表观转录组一样,这些修饰不会影响转录本的序列,而是会对后续的结构和功能产生影响。
==历史==
mRNA 修饰的发现可以追溯到 1957 年假尿苷修饰的发现。
==机制==
=== 复合体 ===
病毒 RNA 修饰使用与细胞 RNA 相同的机制。这涉及到“写入器”和“读取器复合体”的使用。写入器复合体包含类甲基转移酶 3 (METTL3) 及其辅因子,如 METTL14、WTP、KIAA1492 和 RBM15/RBM15B,其中添加了 m6细胞核内的修饰。 称为 YTH 的蛋白质家族(如 YTHDC1 和 YTHDC2)能够检测细胞核内的这些修饰。
=== N6-甲基腺苷 (m6A) ===
这种修饰涉及在 mRNA 分子的腺嘌呤碱基上的第 6 个氮上添加甲基 (-CH3)。这是 1974 年发现的首批 mRNA 修饰之一
大多数 RNA 病毒在细胞质中进行循环,远离细胞核中写入和擦除 m6A 修饰所需的机制。 对于 DNA 病毒,在细胞核中循环并直接进入所述机制,m6A 修饰没有明确的一般正向或负向调节作用。在猿猴病毒和乙型肝炎病毒中,不同的m6A阅读复合物在调节中具有不同的作用,其中一些具有保守的积极作用,而另一些则对复制具有中性或消极作用。
=== O-甲基化 ===
这种修饰涉及在 RNA 分子核糖的 2' 羟基 (-OH) 上添加甲基。
不同的病毒有其获得这种修饰的机制。黄病毒科和冠状病毒等细胞质 RNA 病毒编码催化帽形成反应所需的物质,其中一些需要一种酶来实现 5' 帽和 2-O-甲基化,而其他病毒则需要两种酶,例如痘病毒。
==免疫系统==
病毒 RNA 修饰在与宿主细胞免疫系统的相互作用中发挥着重要作用。病毒 RNA 的 m6A 修饰使得病毒能够逃避 1 型 IFN 反应(先天免疫的关键途径)中视黄酸诱导基因 I 受体 (RIG-I) 的识别. 5' N-7methylguanisone 加帽和 2-O-甲基化在病毒感染中也发挥着重要作用。帽子结构有助于病毒 RNA 融入修改后的细胞 mRNA 中,避免触发免疫反应系统。
分子生物学
病毒学
病毒基因