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'''''''Candidatus'' Azoamicaceae'''' 是 2024 年描述的一个科(生物学)|内共生科 |内共生伽马变形菌,具有 Candidatus(生物学)|候选状态。
它在候选目(生物学)|目 '''''Ca.'' Azoamicales'''(以前称为 '''eub62A3 组''')中是单型的。
家庭的名称和顺序
该群体的成员以其在纤毛虫宿主中进行反硝化的能力而著称。 模式种 ''Ca'' #Azoamicus ciliaticola|Azoamicus ciliaticola 是从纤毛虫的厌氧区分离出来的。楚格湖在瑞士被隔离,并于 2021 年进行描述。

==生态==
对宿主有益的内共生体( 而基因组极度减少的“Ca.”Azoamicus ciliaticola 显然仅以缺氧产生的三磷酸腺苷 | ATP 的形式为其位于楚格湖深处的纤毛虫宿主提供能量,“Ca.”Azosocius相比之下,含水层似乎在其宿主的新陈代谢中发挥着更大的作用。这通过细胞色素 c 氧化酶 cbb3(别名 COX)的保留以及“ccoNOP”基因相对较高的转录(生物学)来表明|“ccoNOP”基因的转录[https:// tcdb.org/search/result.php?acc=F8H841&tc=3.D.4.3.3 3.D.4.3.3] – Cbb3 细胞色素 c 氧化酶。此酶的转运蛋白分类数据库 (TCDB)。。
这表明它们将呼吸的能力传递给了宿主。
这可以解释这种共生伙伴关系在季节性或永久缺氧栖息地的全球分布以及这种共生关系的主要生态作用。

==系统学==

截至2024年12月19日

γ变形菌纲
* 目 '''''Candidatus(生物学)|Candidatus'' Azoamicales''' ** 科 '''''Candidatus'' Azoamicaceae''' *** 属 '''''Candidatus'' Azoamicus''' **** '''''大约'' #Azoamicus ciliaticola|Azoamicus ciliaticola'''ᵀ **** ''大约'' Azoamicus viridis **** ''大约'' Azoamicus soli **** 翡翠水库细菌克隆 Fei_12Nov90m_29 (登录号 AB930564) - 地点:台湾翡翠水库
**** 翡翠水库细菌克隆 Fei_12Dec90m_86 (登录号 AB930693) - 地点:台湾翡翠水库
**** 帕文湖克隆 eub62A3 — 地点:帕文湖
**** 基伍湖梅塔格。重叠群 Ga0116204 — 位置:基伍湖
**** 墨西哥湾细菌克隆 EzyYy290(登录号 KX172462)
*** ''Candidatus'' Azosocius v 属 **** ''大约'' Azosocius agrariusᵀ **** ''大约'' #Azosocius aquiferis|Azosocius aquiferis
-->
*** 属 ''CADEGZ01''
**** ''CADEGZ01 sp013286785'' 与 Gammaproteobacteria 细菌分离株 BWOrgControl_Nextera8_MAG4 (GCA-002422785.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1850859839 JABDFC010000000]。
**** ''CADEGZ01 sp021848375'' 与假单胞菌分离株 SKS4.bin44 (GCA_021848375.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2186543794 JABDFC010000000]。< /参考>
**** ''CADEGZ01 sp027364575'' 与细菌隔离 clean1871 (GCA_027364575.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2417557504 DAHXPC010000000]。
**** ''CADEGZ01 sp902827015'' 与 Proteobacteria sp。 RBC072 (GCA_902827015.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1831051932 CADEGZ010000000]。
*** Gattung ''CAMFJH01''
*** Gattung ''JABDCL01''
**** ''JABDCL01 sp013288135'' mit Gammaproteobacteria 细菌分离株 BWMinControl_Nextera25_MAG1 (GCA_013288135.1)NCBI 核酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1850859698 JABDCL010000000]。
*** Gattung ''JABJGS01''
**** ''JABJGS01 sp018703155'' (GCA_018703155.1) mit Francisellaceae 细菌分离物 SI074_bin154 (GCA_018703155.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2047511104 JABJGS010000000]。
*** Gattung ''JAGOUJ01''
**** ''JAGOUJ01 sp018061325'' mit Gammaproteobacteria 细菌分离物 Gw_Eff_bin_481 (GCA_OI 8061325.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2026855077 JAGOUJ010000000]。
*** Gattung ''JAGVLG01''
*** Gattung ''JAQGOH01''
*** Gattung ''UBA6186''
**** ''UBA6186 sp002422785'' mit Francisellaceae 细菌 UBA6186 (GCA_002422785.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1249620604 DITK01000000]。
**** ''UBA6186 sp903822055'' mit Francisellaceae 细菌分离物 AlinenLipids_bin-5883 (GCA_903822055.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1872009774 CAIJNR010000000]。
**** ''UBA6186 sp903827925'' mit Francisellaceae 细菌分离物 A14_bin-2859 (GCA_903827925.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1871442878 CAIKKE010000000]。
**** ''UBA6186 sp903907935'' mit Francisellaceae 细菌分离物 AlinenLipids_bin-3321 (GCA_903907935.1)NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1872525092 CAIVQA010000000]。
**** GEMO操作分类单位|OTU 17862
**** GEMO操作分类单位|OTU 10623
* Ordnung Francisellales
** 弗朗西斯菌科

* Ordnung Legionellales mit Gattung ''Legionella'' (Legionellen)

* Ordnung Berkiellales mit Gattung ''Berkiella''

* Ordnung Coxiellas

* Ordnung Diplorickettsiales

* 序号__JABCZS01 (GTDB)
** 家族 f__JABCZS01 (GTDB)
*** 加通''JABCZS01''
**** ''JABCZS01 sp013289085'' 与 BWOrgControl_Nextera43_MAG1 (GCA_013289085.1)
**** ''JABCZS01 sp013289605'' 与 BWOrgControl_Nextera69_MAG3 (GCA_013289605.1)

* …
----
ᵀ – Typusart

Die Identifizierung der binären Kandidatennamen ''Ca.'' Azoamicus/Azosocius spp. mit dem jeweiligen Stamm (OHIO1/OHIO2/HAIN) erfolt über die BioSample-Zugriffsnummer (SAM…)。

Wie zu erkennen, wurden etliche Stämme bzw。对 Gammaproteobakterien-Ordnung Thiotrichales (NCBI) 或 Francisellales (Speth ''et al.'', ​​2024) zugeordnet、zählen nach Speth ''et al.'' (2024) 和 GTDB 中的 Francisellaceae 家族进行分离/测序阿伯zur neuen Ordnung und Familie。

== “Candidatus”Azoamicus ciliaticola“ ist eine Kandidatenspezies endsymbiotischer Bakterien insidehalb der Familie ''Ca.'' Azoamicaceae。
Sie zeichnet sich ihre Fähigkeit auszeichnen, in ihrem Ciliaten-Wirt auch in anaeroben Gewässern De Nifikation zu betreiben.
Sie wurde aus dem Zugersee in der Schweiz isoliert und 2021 beschrieben.

“Ca.”Azoamicus ciliaticola“是厌氧内共生体 Süßwasser-Wimpertierchens aus der Klasse(生物学)|Klasse Plagiopylea 的专性内共生体。
Dieses Bakterium enthält ein stark reduziertes Genom mit 0,29 Basenpaar|Mbp (Megabasenpaaren),wobei ein erheblicher Teil davon der Energieproduktion gewidmet ist。
„Ca. Azoamicus ciliaticola 含有一套完整的反硝化基因,使其成为第一个观察到的具有此类代谢途径的专性内共生体。
其广泛的能量代谢遗传潜力表明,内共生体的主要功能是产生三磷酸腺苷(ATP)并使其可供纤毛虫宿主使用。
因此,“大约”Azoamicus ciliaticola 与线粒体具有相似的功能,尽管它与线粒体的细菌谱系之间没有关系。
当它于 2021 年被发现时,出现了其他真核生物是否也使用细菌(或古细菌)将电子转移到非规范电子受体的问题,例如。在反硝化的情况下。
这最初导致发现了与“Ca.”Azoamicus ciliaticola 相关的更多纤毛虫细菌内共生体,从而确定了“Ca.”Azoamicaceae 科的特征。< br/>
== “大约” Azosocius aquiferis 及其纤毛虫宿主通过海尼希地下水样本中的宏基因组学鉴定出来 有趣的是,与楚格湖缺氧区第一个发现的物种“Ca.”Azoamicus ciliaticola(仅控制无氧呼吸,即反硝化作用)相比,该物种编码末端氧化酶(细胞色素 c 氧化酶 cbb 3 别名 COX)。
这种酶使它们能够呼吸氧气和氮气。

==注释==


* Benjamin Thompson、Nick Petrić Howe:[https://www.nature.com/articles/d41586-021-00570-6 新冠肺炎,2020 年和研究丢失的一年]。自然播客( * William H. Lewis、Thijs J. G. Ettema|Thijs J. G. Ettema:“类似于线粒体进化的微生物婚姻。”见:《自然》,第 591 卷,2021 年 3 月 3 日,第 375-376 页;


GTDB:[https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=o__UBA6186 o__UBA6186]。


LPSN:[https://lpsn.dsmz.de/genus/azoamicus 属“''Candidatus'' Azoamicus”]。


国家生物技术信息中心|NCBI分类浏览器:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... 1&srchmode =1&解锁候选人Azoamicaceae],详细信息:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... Candidatus Azoamicaceae”Speth 等人。 2023]


国家生物技术信息中心 | NCBI 生物项目:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1073475 PRJNA1073475]。从地下水样本中回收的呼吸内共生体基因组。


国家生物技术信息中心 | NCBI 生物项目:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB27314 PRJEB27314]。纤毛虫内共生体 Ca.Azoamicus ciliaticola 的基因组序列。


国家生物技术信息中心|NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/256858899 Lake Pavin 克隆 eub62A3]。登录号:GQ390243]。


国家生物技术信息中心|NCBI核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ab930564未培养细菌...克隆:Fei_12Nov90m_29]。登录号:AB930564。


国家生物技术信息中心|NCBI核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ab930564未培养细菌...克隆:Fei_12Dec90m_86]。登录号:AB930693。


国家生物技术信息中心|NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/kx172462 未培养的细菌克隆 EzyYy290 …]。登记号:KX172462。


[https://www.Hydro.uni-jena.de/72/hcze 海尼奇关键区探索]。 弗里德里希·席勒耶拿大学化学地球科学学院水文地质学系主任。


[https://gold.jgi.doe.gov/analysis_project?id=Ga00116204 黄金分析项目 ID:Ga0116204]。 IMG 提交 ID:94481。美国能源部联合基因组研究所 (gold.jgi.doe.gov)。





* [https://mpi-bremen.de/en/New-form-of-sy ... vered.html 发现了新的共生形式]。上:马克斯·普朗克海洋微生物研究所 (MPI-MM) 自 2021 年 3 月 3 日起 ( ** [https://mpi-bremen.de/Neue-Form-der-Sym ... deckt.html 发现新的共生形式]。


* 自 2024 年 2 月 19 日起在 bioRxiv 上预印; doi:10.1101/2024.02.19.580942。
** [https://www.eurekalert.org/news-release ... age=german 不仅仅是氧气:全球内共生体的多样性和新陈代谢]。
* [https://mpi-bremen.de/en/Oxygen-is-not- ... ionts.html 氧气我​

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