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“Plagiopylea”是纤毛虫的一纲(生物学)|纲,属于大核内纤毛虫纲。其中有一些代表发生在厌氧生境中。
在传统分类学中,该类在(生物学)|Plagiopylida 目中是单型的。
根据最近的系统发育分析(Graf ''et al.'', 2021),Plagiopylea 中有两个分支,即除了 Plagiopylida 目(包括“Plagiopyla frontata”和“Trimyema compressum”等物种)之外,还有第二组与 Gammaproteobacteria 纲的反硝化细菌内共生体相关 - 其中包括 Epalxellidae 科,其第一组是在瑞士楚格湖发现的缺氧代表与专性内共生体“Candidatus”Azoamicus纤毛虫。
因此,齿口目(Odontostomatida)包括该科,代表第二个进化枝(假设单系)。
== Plagiopylida 是纤毛虫的一个小目,其成员中的纤毛(或纤毛)密集排列,来自 monokinetids维基词典: :wikt:en:monokinetid|monokinetid (
Plagiopylida 目由 Eugen Small 和 Denis Lynn 于 1985 年引入,作为少膜虫纲的一个亚纲。从那时起,它们通常被视为一个独立的类别;与 Colpodea 的联系也被讨论过。
== 齿口目也是纤毛虫的一个小目。单细胞生物特别利用其(身体)纤毛(cilia)来移动。
“Saprodinium dentatum”被认为是该类群的代表性代表,
其精细结构由 Hans-Gunther Schrenk 和 Christian F. Bardele 于 1908 年描述。
迄今为止的表征集中于对这种高度不对称、横向压缩纤毛虫的体细胞皮层(细胞体的“树皮层”)和口腔纤毛(细胞口区域的纤毛)的详细分析。
细胞形状由一系列特定位置的不同“刺”决定( SK 由二动力类组成,显示出一种分化,这似乎也是其他齿口类的特征。
SK 的前段主要有纤毛,其次是非纤毛段,其中运动体缺乏所有典型的纤维系统。
除 SK 4-6 外,后段再次有纤毛并形成棘动体,其连接到某些尾棘(“尾棘”)。
SK 3 至 SK 7 的前段形成额韧带;与两个额动力学一起,代表用于运动的主要细胞器结构。 在口腔脊柱附近观察到短暂的反向极性动力学,这在之前的光学显微镜研究中显然没有被遗漏。
===内共生===
Graf“等人”对不同深度的样本进行了研究,特别是对瑞士楚格湖的较深缺氧层进行了研究,结果在 2021 年发现了缺氧 Gammaproteobacteria|Gammaproteobacteria ''Ca.'' Azoamicus ciliaticola,发生在内共生|细胞内与其纤毛虫宿主的共生是活的。 使用地下水宏基因组学发现了与“Ca.”Azoamicus 属和“Ca.”Azosocius(均为“Ca.”Azoamicaceae 科)细菌内共生体共生的更多例子海尼希的样品 宏基因组数据指向齿口目纤毛虫宿主。
“Ca.”Azoamicus ciliaticola 的纤毛虫宿主显然不包含任何真正的功能性线粒体,而是代谢减少的线粒体#MRO|线粒体相关细胞器。
系统发育分析表明,这些齿口纤毛虫属于 Plagiopylea 纲。内共生体基因组的极度减少表明它们在纤毛虫目中的长期垂直基因转移|垂直遗传。
Azoamicaceae 家族的细菌似乎已经进化到使用反硝化和吸氧呼吸链产生 ATP 的最小基因集。 事实上,保守的核心基因构成了该家族中最小基因组的 80% 以上的蛋白质补体。
相反,细菌必需的蛋白质是在纤毛虫宿主遗传密码的基因组中编码的,然后翻译(生物学)|生成的蛋白质通过蛋白质生物合成#蛋白质靶向和蛋白质运输|蛋白质靶向引入细菌。
宿主蛋白的靶向性已在昆虫的 HBE、“Angomonas deanei”(锥虫科)中,特别是在“Paulinella | Paulinella chromatophora”的色素细胞以及硝基体中和硝基体中,在极少数情况下得到证实。作为来自“Braarudosphaera bigelowii”(Haptophyta)的细菌“Ca. ”Atelocyanobacter thalassae)观察到。
这种蛋白质靶向发现模糊了 HBE 和细胞器之间的界限。 Azoamicaceae 也可以代表从细菌内共生体 (HBE) 到真正的细胞器转变的另一个例子。
与“Ca.”Azoamicus 相比,“Ca.”Azosocius 属的细菌内共生体似乎并未丧失用氧气呼吸的能力,它们显然使其纤毛虫宿主能够暂时或永久存在。缺氧条件 - 与楚格湖 Anozian 区域的“大约”Azoamicus 不同。
===内共生关系发展的假设===
根据 Graf ''et al.'' (2021),''Ca.'' Azoamicus 细菌与其 Plagiopylea 宿主之间的共生可能如下发生:
# 最初需氧的纤毛虫对缺氧、含硝酸盐的环境的适应涉及其需氧线粒体向氢酶体的转化。 # 获得兼性厌氧反硝化伽马变形菌,它通过内吞作用 (2a) 或作为寄生虫 (2b) 进入厌氧纤毛虫宿主(在后一种情况下,是“Ca”的前体。Azoamicus ciliaticola 已经含有腺苷)三磷酸| ATP/二磷酸腺苷|ADP 转位酶为能量寄生。
# ATP/ADP 转位酶也可能是在稍后的时间点通过横向基因转移 (LGT) 获得的,例如来自 Alphaproteobacteria 类的共生体。长期缺氧和富含硝酸盐的环境可能会导致氧呼吸基因的丧失。结果,今天的共生关系出现在“Ca.”Azoamicus ciliaticola 和 Plagiopylea 纤毛虫之间。
===含义===
内共生体在厌氧纤毛虫中广泛存在。有人认为,互养内共生体在纤毛虫向无氧生活方式(厌氧)的转变中发挥着重要作用。
由于它们具有有氧呼吸的潜力,这些 Azoamicaceae 似乎是细菌纤毛虫内共生体的一个有趣的例子,可以适应微有氧生活方式。
==系统学==
根据 Graf ''et al.'' (2021) 的系统发育分析,Plagiopylea 中有两个分支:一个包括 Plagiopylida 目,另一个包括等等。 来自楚格湖的缺氧纤毛虫,以及属于齿口目 (Odontostomatida) 的 Epalxellidae 科,其种为“Epalxella antiquorum”。在这种情况下,该类将是国家生物技术信息中心的 Odontostomatea | NCBI 分类学中的 Plagiopylea 的同义词。
截至:2024 年 12 月 20 日
进化枝/亚门:巨核内:Ventrata(O,W) [CON三P]
* 类:'''Plagiopylea''' ** 目:齿口目 *** 盘形科 (Discomorphellidae) **** ''Discomorphella'' 属 ***** ''Discomorphella pectinata''ᵀ ***** ''Discomorphella pedroeneasi'' *** 鹬科 Epalxellidae **** ''Atopodinium 属 ***** ''Atopodinium fibulatum''ᵀ **** ''Epalxella'' 属 ***** ''Epalxella antiquorum'' ***** ''Epalxella exigua'' ***** ''Epalxella mirabilis''ᵀ ***** ''Epalxella striata'' **** ''Pelodinium'' 属 ***** ''Pelodinium reniforme''ᵀ **** ''Saprodinium'' 属 ***** ''Saprodinium dentatum''ᵀ ***** ''Saprodinium halophilum'' ***** ''Saprodinium integrum'' *** Mylestomatidae 科 **** ''Mylesoma 属 ***** ''Mylesoma anatinum'' ***** ''Mylesoma bipartitum'' **** 没有流派分配
***** ***** *** 没有流派和家庭分配
**** 进化枝
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798078.1 LR798078] Single_ciliate_S1
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798080.1 LR798081] Single_ciliate_S3
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798081.1 LR798081] Single_ciliate_S4
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798089.1 LR798089] 分离环境样本/宏基因组组装
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798082.1 LR798082]Combined_ciliates_C5
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798083.1 LR798083]Combined_ciliates_C10
**** 进化枝
***** [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LR798079.1 LR798079] Single_ciliate_S2
** 目:'''Plagiopylida''' ***科: Plagiopylidae **** 属:“Lechriopyla” ***** ''Lechriopyla mystax''ᵀ **** 属:“Paraplagiopyla” ***** ''Paraplagiopyla kiboko''ᵀ
* ''Plagiopyla binucleata'' * ''Plagiopyla cucullio'' * ''Plagiopyla frontata'' * ''Plagiopyla marina'' * ''Plagiopyla megastoma'' * ''Plagiopyla minuta'' * ''Plagiopyla narasimhamurtii'' * ''Plagiopyla nasuta''ᵀ * ''Plagiopyla ovata'' * ''Plagiopyla ramani'' * ''Plagiopyla rariseta'' * ''Plagiopylalvesita'' *“Plagiopyla”sp。 F26(N)
*“Plagiopyla”sp。 FG-2015(N)
* ''Plagiopyla'' sp。 PHB07091001(N)
*“Plagiopyla”sp。 QZ-2012(N)
*“Plagiopyla”sp。菌株 F1A(N)
*“Plagiopyla”sp。菌株 JUDRED(N)
*“Plagiopyla”sp。 菌株 OYSTR(N)
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:::* 属: ''Pseudoplagiopyla'' :::** ''Pseudoplagiopyla sinistra''ᵀ :::* 属: ''Schizocaryum'' :::** ''Schizocaryum dogieli''ᵀ ::* 科: Sonderiidae ::** 属:“''Parasonderia''” ::*** ''Parasonderia kahli'' ::*** ''''Parasonderia pestita'' ::** 属: ''Sonderia'' ::*** ''Sonderia cyclostoma'' ::*** ''Sonderia labiata'' ::*** ''Sonderia macrochilus'' ::*** ''Sonderia mira'' ::*** ''Sonderia pharyngea'' ::*** ''Sonderia schizostoma'' ::*** ''Sonderia sinuata'' ::*** ''Sonderia tubebigula'' ::*** ''Sonderia Vesita'' ::*** ''Sonderia vorax'' ::** 属: ''Sonderiella'' ::*** ''Sonderiella scandens''ᵀ ::* 科: Trimyemidae
* ''Trimyema alfredkahli'' * ''Trimyema claviformis'' * ''Trimyema compressum''ᵀ *“艰难梭菌” * ''Trimyema echinometrae'' * ''Trimyema finlayi'' * ''Trimyema foissneri'' * ''Trimyema kahli'' * ''韩国Trimyema koreanum'' ** 韩国树干 - 位置:来自 Seosin 太阳盐的超咸水,[https://mapcarta.com/de/W471440360 Seosin-myeon 工业园区和盐生产厂]。 Mapcarta (en)。 韩国
** 斜壁分离株 LT85_L8NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487870.1 …斜壁分离株 LT85_L8 …]。编号:KC487870。 – 位置:澳大利亚泰瑞尔湖
** 斜壁分离株 LT85_G13NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487772.1 … 斜壁分离株 LT85_G13 …]。登记号:KC487772。 – 地点:澳大利亚泰瑞尔湖
** 斜壁分离株 LT85_G24NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487781.1 … 斜壁分离株 LT85_G24 …]。登记号:KC487781。 – 地点:澳大利亚泰瑞尔湖
** 斜壁分离株 LT85_B18NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC487685.1 … 斜壁分离株 LT85_B18 …]。登记号:KC487685。 – 地点:澳大利亚泰瑞尔湖
* ''Trimyema marinum'' *“微小三丝虫”(N) 与“嗜热微小三丝虫”(N)
** 隔离 EV10
* ''Trimyema pleurispirale'' * ''Trimyema shoalsia'' *“Trimyema”sp。 Lake6(N) – 地点:澳大利亚怀阿拉的超咸水
*“Trimyema”sp。 OH3A(N) – 地点:加利福尼亚州索尔顿西
*“Trimyema”sp。 S11B(N) – 地点:高盐环境,鲨鱼湾,澳大利亚
*“Trimyema”sp。 S13B(N) – 地点:高盐环境,鲨鱼湾,澳大利亚
*“Trimyema”sp。 S15B(N) – 地点:澳大利亚鲨鱼湾高盐环境
*“Trimyema”sp。 SD1A(N) – 位置:超盐环境,丘拉维斯塔,加利福尼亚州
*“Trimyema”sp。菌株 FARO3(N) – 地点:葡萄牙 Quelfes
*“Trimyema”sp。菌株 FRESH(N) – 地点:法尔茅斯(马萨诸塞州)
*“Trimyema”sp。菌株 JUD81(N) – 地点:纳拉甘西特(罗德岛州)
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:(N) – 分类 :(O) – :(T) – 分类学。通用分类服务,荷兰 Zwaag
:(W) – :? – 不确定
:ᵀ – 类型物种
==注释==
纤毛虫的纤毛大多排列成单动体和二动体,各有一个或两个动体(基体),每个动体可携带一根纤毛。这些排列成行,运动(
* Benjamin Thompson、Nick Petrić Howe:[https://www.nature.com/articles/d41586-021-00570-6 新冠肺炎,2020 年和研究丢失的一年]。自然播客( * William H. Lewis、Thijs J. G. Ettema|Thijs J. G. Ettema:“让人想起线粒体进化的微生物婚姻。”见:“Nature”,Band 591, 3. März 2021,S.375-376;
国家生物技术信息中心|NCBI分类浏览器:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=1249559&lvl=3&keep=1&srchmode=3&unlock Plagiopylea],详细信息: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1249559 '''Plagiopylea''' Small & Lynn,1985](类)。
国家生物技术信息中心|NCBI分类浏览器:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=408070&lvl=3&keep=1&srchmode=3&unlock Odontostomatida],详细信息: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=408070 Odontostomatida](顺序)。
国家生物技术信息中心|NCBI分类浏览器:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=35111&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=2&unlock Trimyemidae],详细信息: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=35111 Trimyemidae](科)。
国家生物技术信息中心|NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EF526988 未培养的海洋真核生物克隆 MA1_3F12 …]。登记号 EF526988。
国家生物技术信息中心|NCBI 核苷酸:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ab902303 未培养的真核生物……克隆:OD_A_2012Dec_100]。登记号AB902303。
蠕虫。 [https://marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=414717 Plagiopylea](类)。
蠕虫:[https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=163017 Odontostomatida](订购)。
海洋生物地理信息系统|OBIS:[https://obis.org/taxon/414717 Plagiopylea Small & Lynn,1985](班级)。
海洋生物地理信息系统|OBIS:[https://obis.org/taxon/163017 Odontostomatida Sawaya,1940](订单)。
S. J.品牌(Hrsg.):[http://taxonomicon.taxonomy.nl/TaxonTree.aspx?id=124145&src=0 Genus Saprodinium Lauterborn, 1908(原生生物)Small & Lynn, 1985(原生生物)] 。通用分类服务 (taxonomicon.taxonomy.nl)。展位:2024 年 2 月 1 日。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/trimyema.htm ''Trimyema''] 拉基,1925 年。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/discomor.htm ''Discomorphella''] Corliss,1960。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/atopodin.htm ''Atopodinium''] Kahl,1932。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/pelodini.htm ''Pelodinium''] 劳特伯恩,1908 年。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/epalxell.htm ''Epalxella''] Corliss,1960。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/mylestom.htm ''Mylestom''] Kahl,1928。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/morpho/ciliopho/saprodin.htm ''Saprodinium'']劳特伯恩,1908年。
NIES:[https://www.nies.go.jp/chiiki1/protoz/refere/id4999/4327.htm 参考 ID:4327]。汉斯·冈瑟·施伦克 (Hans-Gunther Schrenk) 和克里斯蒂安·F·巴德尔 (Christian F. Bardele);作为齿口目(Ciliophora)代表的 Saprodinium dentatum Lauterborn,1908 年的精细结构。 J.原虫。 38(3):278-293, 1991.
[https://www.Hydro.uni-jena.de/72/hcze 海尼奇关键区探索]。 弗里德里希·席勒耶拿大学化学地球科学学院水文地质学系主任。
Byung Cheol Cho、Jong Soo Park、Kuidong Xu、Joong Ki Choi:“‘Trimyema koreanum’’ n. sp. 的形态学和分子系统学,一种来自日光盐场超咸水的纤毛虫。”见: 《真核微生物学》,第 55 卷,第 5 期,2008 年 9 月至 10 月,第 417-426 页;
* [https://mpi-bremen.de/en/New-form-of-symbiosis-discovered.html 发现了新的共生形式]。上:马克斯·普朗克海洋微生物研究所 (MPI-MM) 自 2021 年 3 月 3 日起 ( ** [https://mpi-bremen.de/Neue-Form-der-Symbiose-entdeckt.html 发现新的共生形式]。
Karla B. Heidelberg、William C. Nelson、Johanna B. Holm、Nadine Eisenkolb、Karen Andrade、Joanne B. Emerson:“澳大利亚高盐湖泰瑞尔湖真核微生物多样性的表征。”摘自:“微生物学前沿” ',第 4 卷, ,秒。水生微生物学,2013 年 5 月 13 日;
Ran Li、Wenbao Zhuang、Xiaochen Feng、Hunter N. Hines、Xiaozhong Hu:“对‘Trimyema claviforme’’的首次重新描述和分子系统发育”Kahl,1933 年,并描述了中国种群的“Plagiopyla nasuta”Stein, 1860(Ciliophora,Plagiopylea)。”见:“欧洲原生学杂志”,第 90 卷,8 月2023,第 126003 页;
Letizia Modeo、Sergei I. Fokin、Vittorio Boscaro、Ilaria Andreoli、Filippo Ferrantini、Giovanna Rosati、Franco Verni、Giulio Petroni:“纤毛虫“Sonderia vorax”的形态学、超微结构和分子系统学,以及对纤毛虫“Sonderia vorax”系统学的见解Plagiopylida 目。”见:“BMC 微生物学”,第 13 卷,第 40 期,2013 年 2 月,第 40 页;
* 自 2024 年 2 月 19 日起在 bioRxiv 上预印; doi:10.1101/2024.02.19.580942。
** [https://www.eurekalert.org/news-releases/1067572?language=german 不仅仅是氧气:全球内共生体的多样性和新陈代谢]。
* [https://mpi-bremen.de/en/Oxygen-is-not-the-limit-Diversity-and-metabolic-potial-of-globally-distributed-endosymbionts.html 氧气我