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'''''Ignisphaera''''' 是古细菌门 Thermoproteota 中的一个属(生物学)|属。
在权威的 模式种“Ignisphaera aggregans”(参考菌株 AQ1.S1)是一种球状、严格厌氧、超嗜热的古细菌。它是在新西兰罗托鲁瓦市库伊劳公园的温泉中发现的(北岛(新西兰)|北岛)。
在堪察加半岛乌松火山|乌松的温泉中发现了第二种物种“Ignisphaera cupida”(具有重组株 4213-co)。
然而,从宏基因组学来看,有证据表明该属的许多其他物种分布在世界各地的陆地温泉中,例如:黄石国家公园(美国)、马来西亚自然保护区国家公园和保护区|宋溪(马来西亚)、腾冲#地质|腾冲(中国),参见#物种列表|§物种列表。
== 描述 ==
模式种“I”的参考菌株 AQ1.S1ᵀ。 “聚集蛋白”是从“火杆菌”棒的财团(微生物学)|财团中培养出来的,这些棒与其他棒一起来自新西兰的地热环境。
该菌株的细胞是厌氧异养的。它们的形态为规则到不规则的球状(球状),偶尔形成大的聚集体,特别是当使用多糖如葡甘露聚糖|魔芋葡甘聚糖作为碳源时。该菌株的生长温度为85至98摄氏度|°C(最佳温度为92–95°C)。
这些微生物是中度嗜酸(生态)|嗜酸(喜酸或耐酸),生长发生在5.4至7.0(最佳6.4)的pH范围内。通过添加硫和氯化钠 (NaCl)(最好不添加 NaCl)来抑制生长。不需要电子受体。该菌株使用淀粉、胰蛋白酶蛋白胨、[https://www.sigmaaldrich.com/DE/de/search/trypticase?focus=products&page=1&perpage=30&sort=relevance&term=trypticase&type=product 胰蛋白酶大豆肉汤 (TSB) 单淀粉、瓶装肉汤]。上:Merck SigmaAldrich。 乳糖、葡萄糖、葡甘聚糖|魔芋葡甘聚糖、甘露糖、半乳糖、麦芽糖、糖原和环糊精|β-环糊精作为碳源。 G+C含量为52.9mol%。 根据16S rRNA基因序列分析和生理特征,该新种菌株被归属于Thermoproteota(“Crenarchaeota”)中的一个新属“Ignisphaera aggregans”。
==物种列表==
目前公认的分类法基于
属(生物学)|属 '''''Ignisphaera'''''
* 物种(生物学)|物种 '''''Ignisphaera aggregans''''' ** 菌株 DSM 17230(L,N,G) 别名 AQ1.S1 或 JCM 13409(L,N) - 地点:温泉|新西兰罗托鲁瓦市 Kuirau 公园的温泉(北岛(新西兰)|北岛)
* 物种 ''Ignisphaera cupida'' ** 菌株 4213-co(L,N,G) 别名 JCM 39446、UQM 41593 或 VKM B-3715(L,N) - 位置:[温泉|乌松火山(火山)的温泉|堪察加半岛的乌松。
** 菌株 KUA_Bin16(N,G) - 地点:来自堪察加半岛乌松火山(火山)|乌松火山口温泉的元基因组(N)
* 物种“Ignisphaera sp020832925”(G) ** 菌株 Bin S23(N,G) - 位置:来自美国黄石国家公园间歇泉溪扇形温泉温泉的元基因组(N)
* 物种“Ignisphaera sp020833345”(G) ** 菌株 Bin S33(N,G) - 地点:来自美国黄石国家公园间歇泉溪扇形温泉温泉的元基因组(N)
** 行李箱箱 P2(N,G) – 位置:同上。(N)
* 物种“Ignisphaera sp025058535”(G) ** 菌株 SKYB63(N,G) - 地点:马来西亚自然保护区国家公园和保护区|马来西亚宋溪、州立国家公园和保护区碱性温泉棕色生物膜的宏基因组(N)
** 菌株 SKW276(N,G) – 位置:同上。(N)
** 菌株 SKYBB_hs_bin59(N,G) - 位置:同上。(N)
* 物种“Ignisphaera sp028275745”(G) ** 菌株 RSNS17(N,G) - 地点:美国黄石国家公园黄石湖温泉(N)
* 物种“Ignisphaera sp028275825”(G) ** 菌株 RSNS13(N,G) - 地点:美国黄石国家公园黄石湖温泉(N)
* 物种“Ignisphaera sp030550585”(G) ** 菌株 DRTY-1.bins.6.201808(N,G) - 位置:池 DRTY-1 ('''D'''i'''R'''e'''T'''i'''Y'''anQu-1),腾冲#Geology|云南腾冲,中国(N)
** 后备箱…(G)
* 物种“Ignisphaera sp038735125”(G) ** 菌株 DRTY-1_201705_bins_10(N,G) - 位置:池 DRTY-1 ('''D'''i'''R'''e'''T'''i'''Y'''anQu-1),腾冲#Geology|云南腾冲,中国(N)
** 后备箱…(G)
* 物种 ''Ignisphaera sp038820005''(G) ** 应变 ZZQ_201803_bins_118(N,G)
** 后备箱…(G)
* 物种“Ignisphaera sp038821645”(G) ** 根 GMQP_201803_bins_8
** 后备箱...
* 物种“Ignisphaera sp038831005”(G) ** 菌株 GXS_201912_bins_28(N,G)
** 后备箱…(G)
* 物种“Ignisphaera sp038889075”(G) ** 菌株 SRBZ-1_201808_bins_18(N,G)
** 后备箱…(G)
* 物种“Ignisphaera sp038892955”(G) ** 应变 ZMQR_201705_bins_30(N,G)
** 应变 ZZQ_201901_bins_2(N,G)
* 物种“Ignisphaera sp938074605”(G) ** 菌株 S1_Bin_METABAT__310_1(N,G)
* 物种“Ignisphaera” sp。 Tok1(N)
** 菌株 Tok1(N)
* 物种“Ignisphaera” sp。 Tok10A.S1(N)
** 菌株 Tok10A.S1(N)
* 物种“Ignisphaera” sp。 Tok37.S1(N)
** 菌株 Tok37.S1(N)
* 物种“Ignisphaera” sp。 ILS 400(N) ** 菌株 ILS 400(N,G) - 位置:来自温泉微生物垫的宏基因组,Surujkhurd,印度选区列表#Jharkhand|Barkatha,贾坎德邦,印度(N)
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* L – * N – 分类 * G – 第一个菌株(或第一个重叠群#MAGs|MAG)是典型菌株(
== 名字由来 ==
属名“Ignisphaera”源自
* 物种绰号“aggregans”是
* 物种绰号 ''cupida'' 是
==应用==
内切-β-1,4-半乳聚糖酶是来自 GH53 蛋白家族的葡萄糖苷酶|糖苷水解酶 (GH),属于最大的 GH 家族(“家族”),即 GH-A 家族。 Sebastian J. Muderspach 等人于 2021 年研究了该家族的生物多样性,特别是来自“Ignisphaera aggregans”(IaGal) 的超热稳定内切 β-1,4-半乳聚糖酶。这是第一个来自超嗜热古菌的 GH53 半乳聚糖酶,适合作为开发具有不同详细特性的热稳定性酶的起始形式或支架。
13068 2021 2025 Fig3.webp|来自“I. 13068 2021 2025”的内切-β-1,4-半乳聚糖酶的结构概述。聚集蛋白 (IaGal)
13068 2021 2025 Fig4.webp|“曲霉|棘孢曲霉”(AaGal)、“I. 13068 2021 2025”的内切-β-1,4-半乳聚糖酶的底物结合位点聚集蛋白”(IaGal) 和“地衣芽孢杆菌”(BlGal)。
13068 2021 2025 Fig6.webp|具有扩展亚基的内切-β-1,4-半乳聚糖酶(Gal)变体的分子动力学模拟。
13068 2021 2025 Fig7.webp|Endo-β-1,4-半乳聚糖酶 (Gal):已删除(删除|删除)子位点变体的分子动力学模拟。 MtGal:来自“毁丝霉|嗜热毁丝霉”的 Gal [同义词。 ''嗜热酵母|嗜热嗜热酵母'']
13068 2021 2025 图9.webp|糖苷酶中具有π-π相互作用的高度保守区域|糖苷水解酶-53 (GH53)半乳聚糖酶。
==注释==
==进一步阅读==
* * Chris S. Knappy、Charlotte E.M. Nunn、Hugh W. Morgan、Brendan J. Keely:“古细菌“Ignisphaera aggregans”的主要脂质核心:对甘油单烷基甘油四醚类异戊二烯脂质的系统发育和生物合成的影响。”见:“极端微生物”,第 15 卷,第 4 期,2011 年 7 月,第 517–528 页; *
LPSN:[https://lpsn.dsmz.de/genus/methanothermus Genus ''Ignisphaera''] Niederberger ''et al.'' 2006。对此:
* BacDive|Bac''Dive'':[http://bacdive.dsmz.de/index.php?search=Ignisphaera&submit=Search ''Ignisphaera''],德国微生物和细胞培养物保藏中心 (DSMZ)。
国家生物技术信息中心|NCBI分类浏览器:[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?command=show&mode=tree&id=334767&lvl=3 Ignisphaera],详细信息: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=334767 ''Ignisphaera''] Niederberger 等人。 1982(属);以图形方式:[https://lifemap.cnrs.fr/tree?tool=search&tid=334767&efficiency-mode=true ''Ignisphaera''],在 Lifemap 上。
GTDB:[https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=g__Ignisphaera ''Ignisphaera'']。
马库斯·戈克、布列塔尼·赫尔德、阿拉·拉皮杜斯、马特·诺兰、斯特凡·斯普林、蒙特里·亚萨旺、苏珊·卢卡斯、蒂贾娜·格拉维纳·德尔·里奥、霍普·泰斯、程锦芳、琳恩·古德温、罗克珊·塔皮亚、山姆·皮特拉克、康斯坦丁诺斯·利奥利奥斯、娜塔莉亚·伊万诺娃、康斯坦丁诺斯·马夫罗马蒂斯、娜塔莉亚·米哈伊洛娃、阿姆丽塔·帕蒂、陈艾米Krishna Palaniappan、Evelyne Brambilla、Miriam Land、Loren Hauser、Yun-Juan Chang、Hans-Peter Klenk ''et al.'':“''Ignisphaera aggregans'' 型菌株的完整基因组序列 (AQ1.S1T)。”见:“基因组科学标准”,第 3 卷,第 1 期,2010 年 8 月 30 日,ISSN 1944-3277,第 66-75 页;
Sebastian J. Muderspach、Folmer Fredslund、Verena Volf、Jens-Christian Navarro Poulsen、Thomas H. Blicher、Mads Hartvig Clausen、Kim Krighaar Rasmussen、Kristian B.R.M. Krogh、Kenneth Jensen、Leila Lo Leggio:“从‘Ignisphaera aggregans’中设计超热稳定古细菌内切 β-1,4-半乳聚糖酶的底物结合位点。”载于:“生物燃料生物技术”,第 14 卷,2021 年 9 月 16 日,第 183 页;
Thomas D. Niederberger、Dorothee K. Götz、Ian R. McDonald、Ron S. Ronimus、Hugh W. Morgan:“Ignisphaera aggregans”gen。十一月,SP。 nov.,从新西兰罗托鲁瓦和托卡努的温泉中分离出的一种新型超嗜热骨灰菌。”见:《国际系统与进化微生物学杂志》,第 56 卷,第 5 期,2006 年 5 月 1 日,第 965-971 页;
Olga A. Podosokorskaya、Alexander G. Elcheninov、Alexandra A. Klyukina、Alexander Y. Merkel:“Ignisphaera cupida” sp。 11 月,来自 Uzon(堪察加半岛)温泉的超嗜热水解古菌,并修正了 Ignisphaera 属的描述。”见:“系统与应用微生物学”,第 47 卷,第 5 期,2024 年 9 月,第 126541 页;
类别:TACK [/h4]
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